化学实验室经常会产生一些有毒的气体、液体和废渣需要处理，如果直接排放会污染空气和水源，造成环境污染，实验室本身也是一个密闭空间，“三废”物质未经处理直接排放也会给实验工作人员的身心健康带来危害。因此，实验室的废气、废液、废渣必须经过处理后，才能排弃，严禁将浓酸、浓碱废液和含有铬、汞、铅等重金属元素的废液以及不能溶解的固体物质倒入水池，以防堵塞和腐蚀管道。
1.实验室废气的处理① 产生有毒废气的实验应在通风柜内进行，通过排风设备将有毒气体排出室外。② 气相色谱仪器检测器出口的废气应通过万向吸气罩及时排除实验室。③ 煤质分析室各类分析仪器(如工分仪、测硫仪、元素测定仪、灰熔点测定仪)和原子吸收仪产生的废气应通过原子吸收罩及时排出实验室。④ 气体分析实验完成后，应将取样用的球胆、钢瓶等取样容器放在通风柜内，防止容器内剩余的气体渗漏到室内。⑤ 对有毒气体实验应改进试验装置，采用闭路、循环等装置避免有毒气体泄漏。
2. 实验室废液的处理① 一般的酸碱和不含重金属离子的盐类废液，用酸碱中和的办法，将pH调整到6~8，方可倒入水槽排除。②含有氰的废液应及时处理，可用高锰酸钾在碱性条件下分解，或者NaCLO分解成CO2和N2后排入水槽。③ 含有铬、汞、银、镉、铜、锰等重金属离子的废液，用碱液沉淀，加絮凝剂沉淀，达标后排放。④ 若不小心将金属汞(水银)洒落在实验室地面上，必须用吸管、毛笔或者硝酸汞溶液浸渍过的薄铜片将所有汞滴捡起，收集于适当的瓶子中，用水覆盖起来。洒落过汞的地面应撒入硫磺粉，将洒落区覆盖一段时间，使其生成硫化汞，在设法扫净;也可喷洒20%的三氯化铁溶液，让其自行干燥后再行清扫。
3.实验室废渣的处理对有毒的废渣应及时处理，一般固体，可集中定期处理;有价值的可以进行回收处理;少量无价值的固体可焚烧或者采用深埋的方式处理。